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原来商毅离开南京之后，南京城内的秩序和运转一直都很好，內阁成员都在尽心尽责的操持着国政，后宫由林凤舞主持，也十分安宁。
而帝国的另一个重要机构——国会，也在黄宗羲、顾炎武等人的操持之下，也在有条不紊的建设中。各地的议员都己经选拔出来，赶到了南京汇集,正在进行最后的陪训，让他们知道国会的制度、秩序，怎样行使议员的权力等等。
当然按中国的规矩，国会成立，必须要有一篇宣言誓文一类的东西，以证明国会成立的必要性，而这个任务自然也落到了黄宗羲的头上，黄宗羲当然不会推辞，因此也洋洋洒洒，写了一大篇，其中开篇写道：三代以下，天下之是非一出於朝廷。天子荣之，则群趋以为是；天子辱之，则群擿以为非。然今之中国，其意不在此也，天子之所是未必是，天子之所非未必非，天子亦遂不敢自为非是，公其非是出於国会。而必使治天下之具皆出於国会，为设国会之意始备也。
这一段话中，有不少是商毅比较熟悉的句子，都是出于黄宗羲的［明夷待访录］里面，后面还有不少，如黄宗羲在说明议员的责任时,也写道：故我之出仕议员，为天下，非为君也；为万民，非为一姓也。吾以天下万民起见，非其道，即君以形声强我，未之敢从也，况於无形无声乎！非其道，即立身於其朝，未之敢许也，况於杀其身乎！也是出于［明夷待访录］里面。
在另一时空里，虽然［明夷待访录］书成于十七世纪六十年代初，离现在还有十余年的时间，但其中的主要思想，在这个时候，也基本成型，大致的原稿都己写出来了。不过和另一时空相比，本时空的黄宗羲一来是公务事情大量増加，写书做学问的时间减少了许多，［明夷待访录］的进度也慢得多；另一方面，由于商毅的大力推崇，欧州的人文、自由、理性、民主等思想都大量传入了中国，也对黄宗羲起了不小的影响，也需要时间来消化吸收，当然也影响到［明夷待访录］的成书。因此现在只完成了四五篇手稿。只是在一些朋友之间传阅，并没有公开。而这次为国会写宣言，黄宗羲也引用了不少手槁里的原文。
写成之后，黄宗羲也交给内阁过目，王夫之、李岩等人对这篇［国会宣言］也极为赞赏，因为他们经常和商毅交流讨论国会的事情，非常理解商毅一定要成立国会的用意，认为这篇［国会宣言］非常明确而完全表达了成立国会的目地，因此也在政府內部传阅。
但就是这一传阅，出了大问题。因为现在帝国政府的官员数量大増，相应的培养却不能完全跟上，也是有些稂莠不齐，投机份孑也混进来不少，另外也不是所有官员都能明白商毅成立国会的意图，尽管政府在成立国会的文件中介绍过国会的性质，只是官面文章做得虽好，但还看怎么来理解。
有不少官员的理解是，国会是商毅用来削减內阁权力，达成朝廷势力平衡的工具。当然从一定程度上来说，这样理解也不能算错，三权分立从本质上来说，也就是为了权力互相制约，达到一个平衡局面。只是看站在什么立场上看待。
但如果还是站在过去的专制立场，黄宗羲的这篇宣言的着力点就大错特错了，由其是其中的一些语句，如“天子之所是未必是，天子之所非未必非，天子亦遂不敢自为非是”，“故我之出仕议员，为天下，非为君也；为万民，非为一姓也”等筹，就是十足的大逆不道了。
因此在宣言被众官员传阅的第三天，就有官员上书内阁，认为［国会宣言］写得不妥，要求国会重写。当然这样的表述其实还很温和，而內阁成员讨论之后，由王夫之代表内阁答复，认为［国会宣言］并无不妥，无需重写。
而这时，有些官员认为从中可以找到机会，组织部下一个司长崔文镜和宣传部的副部长方守礼两人不约而同的再次上书，严励指责黄宗羲写的这篇［国会宣言］是欺君枉上，颠倒人伦，满篇俱是狂言，无视君臣纲常，犯下了大不敬之罪，要求立刻将黄宗羲缉拿，交由刑部治罪，同时内阁对此敷衍了事，包庇纵容，都犯有失责之罪，应该立刻引咎辞职。
有这两个人一起头，立刻又得到了一些官员的响应，随后几天，一共有十二名官员上书内阁，有人攻击黄宗羲，有人攻击內阁，甚致还有人攻击国会，但也有官员支持内阁的意见，认为这些官员都是无理取闹，结果也越闹越大，卷进来的人也越来越多，渐渐竞似有党争的样孑。
而且也不知是谁，通过什么手段，居然又把黄宗羲［明夷待访录］的原稿翻了出来，从中又找到了不少大逆不道之言，如：“凡天下之无地而得安宁者，为君也”，“然则为天下之大害者，君而已矣”等等。又使不少人找到了攻击的目标，毕竟［国会宣言］里的几句，还免强说得过去，但这几句话，确实是直指皇帝说的，因此扣上怎样的帽子，也不为过。当然有些人是以此为向上爬的良机，但也有人纯粹是由于个人的思想太守旧，确实跟不上现在社会形式的发展。
事情发展到了这一步，内阁当然也就压不下去了，因为内阁本身，就成为攻击的目标，无论做出怎样的处理，都难以服众。而且现在商毅和叶瑶瑱都不在南京，没有人能够做最终的决定，因此王夫之和李岩也只能进宫去求见林凤舞，希望她能够出面，来平息争端。
但在商毅离开的时候，只是让林凤舞代管后宫，并沒有处理朝政的权力，到不是商毅对林凤舞不放心，不想授权给她，而是既然帝国是走立宪的道路，那么内阁就应该担付起付责来。而另一方面，林凤舞也清楚，自已的威望和能力都比不上叶瑶瑱，就是出面了，也压不住场，相反还会担上后宫干政的罪名。
只是现在的局面如果再不加以控制，任其下去，恐怕就造成党争局面,王夫之、李岩等人对明末的党争教训还记忆犹新，现在帝国才刚刚成立不到两年,一但发生了党争,就不好收拾了,另外也觉得对不起商毅的重托。
因此林凤舞和内阁商议之后，以国会的名议下令，这件事情关系重大，只能上报给皇帝，听候皇帝裁决，而在皇帝的裁决没有发回南京之前，其他不许再争论这件事情，各官员各付其责，各尽其职，不得误了自己的本职工作。否则内阁将依律处治。
这一来把事情都推到了商毅的身上，也是名正言顺，谁也没有话说，只能接受，这样才算是把这件事情给免强压了下去。不过那些官员们都在收集证据资料，暗地里准备，只等商毅回京，重新点燃战火。
商毅接到报告之后，也只能苦笑无语。在从南京出发之前，他考虑过自己不在南京的时候，有可能会发生什么事情，虽然想了很多种，但确实没有想到，会出现这种情况，以他的观念，黄宗羲的这篇［国会宣言］的观点当然是绝对正确的，但仍然引发了这一场争论，也可见封建君权，在中国的影响力是何等深重，民主政治果然不是短时间能建立起来的。因此自己对中国的改造，还是任重道远啊。
叶瑶瑱见他面带不愉之色，劝道：“哥哥不用着急，再有二三天的时间就到了南京了，也就能够拔乱返正。”
商毅苦笑道：“这样的事情，还要我亲自出面，才能拔乱返正吗？”
叶瑶瑱笑道：“哥哥的心意虽好，但未必是所有人都懂啊，只能慢慢来。”
紫玲珑却有些不解，道：“你是怎么了，‘天子之所是未必是，天子之所非未必非’，‘为天下，非为君也；为万民，非为一姓’，这样的话在那个朝廷里都是大逆不道的言论啊，如果是在清廷，黄宗羲恐怕早就被抓起来砍脑袋了，你还觉得他说得对，难到你有毛病吗？”
商毅摇了摇头，道：“皇帝也是人，是人就不可能什厶都懂，就会有犯错，就会有不对的地方，所以两个凡是的思想，绝不能当作政府的指导思想。”
紫玲珑怔了一怔，道：“什么叫两个凡是。”
商毅笑了笑，道：“就是凡是皇帝说的话，都是对的；凡是皇帝决定的事情，就必须去做。你觉得这种观点对吗？如果我说白色是黑色，黑色是白色，是否就是对的；如果我下旨横征暴敛，渔肉天下，是不是就该去执行呢？历代灭国亡朝，虽然有各种原因，但这两点必然是其中之一。”
紫玲珑呆呆的看着商毅，过了好半天才道：“你这个人真怪，虽然你说得没有错，但历代的皇帝，那一个不是希望臣下认为凡是皇帝说的话，都是对的；凡是皇帝决定的事情，就必须去做。只有这样，才能保证皇权的威严，保证江山永固。”
商毅又笑笑，道：“皇权的威严，并不在这个上面，诚如你所说的，历代的皇帝，确实都自已说的话，都是对的；自己决定的事情，就必须去做。但又有那一个朝代的江山能够永固呢？既然是这样，那么我们为什么换一种当皇帝的方式。”